（一）辦公室（行政審批科）。負責文電、機要、保密、檔案、會務、督查督辦、后勤服務等機關日常運轉工作，承擔文字綜合、政務公開、科技宣傳、新聞發(fā)布、輿情應對、信息化建設、網(wǎng)絡安全、信訪、安全和重大事件應急處置等工作。負責行政審批事項的受理和審批。
（二）規(guī)劃與平臺科。牽頭擬訂市科技創(chuàng)新發(fā)展、規(guī)劃并協(xié)調實施，組織開展技術預測，承擔市重大科技決策咨詢制度運行相關工作。承擔建立市科技管理平臺和科研項目資金協(xié)調、評估、監(jiān)管機制相關工作，協(xié)調提出科技資源合理配置的政策措施建議。承擔市財政科技計劃（專項、基金等）協(xié)調管理工作，建設管理市科技管理信息系統(tǒng)，指導項目管理專業(yè)機構建設，承擔科技統(tǒng)計相關工作，實施市科技報告制度和市創(chuàng)新調查制度。提出科技創(chuàng)新基地和科研條件保障規(guī)劃建議并監(jiān)督實施。推進科技資源和科學數(shù)據(jù)開放共享。負責本部門預算與財務管理相關工作。
（三）政策法規(guī)與監(jiān)督科。承擔推進市創(chuàng)新體系建設和科技體制改革工作，擬訂科技創(chuàng)新政策措施，組織起草相關地方性法規(guī)和規(guī)章草案并開展普法宣傳。承擔科技監(jiān)督評價體系建設和科技評估管理相關工作，提出科技評價機制改革的政策措施建議并監(jiān)督實施，開展科技評估評價和監(jiān)督檢查工作。擬訂科研機構改革發(fā)展與布局的規(guī)劃和政策并監(jiān)督實施，組織開展科研機構創(chuàng)新績效管理。負責科技安全、科技保密等相關工作，建立健全科技依法行政制度體系。承擔市科技創(chuàng)新工作領導小組辦公室日常工作和科研誠信建設工作。
（四）高新技術發(fā)展與產業(yè)化科。擬訂相關領域高新技術發(fā)展與產業(yè)化的規(guī)劃和政策。組織開展相關領域技術發(fā)展需求分析，提出重大任務并監(jiān)督實施，推動重大關鍵技術攻關。提出相關領域平臺、基地規(guī)劃布局并組織實施。
（五）農村科技科。擬訂科技促進農業(yè)農村發(fā)展的規(guī)劃和政策，開展相關領域技術發(fā)展需求分析，提出重大任務并監(jiān)督實施，推動重大關鍵技術攻關。指導農村科技進步和縣域創(chuàng)新驅動發(fā)展工作，負責科技扶貧工作，推動農村科技社會化服務體系建設。提出相關領域平臺、基地規(guī)劃布局并組織實施。
（六）社會發(fā)展科技科（高新技術產業(yè)開發(fā)區(qū)科）。擬訂社會發(fā)展領域科技創(chuàng)新的規(guī)劃和政策，擬訂新一代信息領域高新技術發(fā)展與產業(yè)化、生物醫(yī)藥領域高新技術發(fā)展與產業(yè)化和衛(wèi)生健康領域科技創(chuàng)新的規(guī)劃和政策。組織開展相關領域技術發(fā)展需求分析，提出重大任務并監(jiān)督實施，推動重大關鍵技術攻關。提出相關領域平臺、基地規(guī)劃布局并組織實施。承擔區(qū)域科技創(chuàng)新體系建設工作，組織擬訂促進高新技術產業(yè)開發(fā)區(qū)發(fā)展等相關政策和措施建議。
（七）成果轉化與獎勵科。承擔國家技術轉移體系工作，提出科技成果轉移轉化及產業(yè)化、促進產學研深度融合、科技知識產權創(chuàng)造的相關政策和措施建議，推動科技服務業(yè)、技術市場和科技中介組織發(fā)展。組織擬訂科技企業(yè)孵化器、眾創(chuàng)空間、大學科技園、產業(yè)技術創(chuàng)新聯(lián)盟發(fā)展的相關政策和措施建議，組織編制和指導實施科技企業(yè)孵化器、眾創(chuàng)空間、大學科技園、產業(yè)技術創(chuàng)新聯(lián)盟的科技發(fā)展規(guī)劃和計劃。負責組織、評定、推薦科學技術獎、政府友誼獎工作。
（八）科技企業(yè)服務科。推動企業(yè)科技創(chuàng)新能力建設，提出激勵企業(yè)技術創(chuàng)新的政策建議。負責科技金融的相關綜合協(xié)調工作，研究提出促進科技型企業(yè)發(fā)展的政策建議，負責組織實施高新技術企業(yè)培育、認定與管理工作。
（九）外國專家與國際合作科。擬訂并組織實施全市引進外國專家管理辦法和國外專家表彰獎勵辦法。擬訂引進國外智力和出國（境）培訓工作規(guī)劃、政策和年度計劃并監(jiān)督實施，組織實施重點出國（境）培訓項目。負責全市外國專家管理服務和外國專家來撫工作相關管理工作，協(xié)調實施外國人才簽證制度，推動建立外國專家、團隊吸引集聚機制和重點外國專家聯(lián)系服務機制，承擔重點外國專家服務工作，負責處理引進外國智力中的重大事件。擬訂科技對外交往、科技交流及創(chuàng)新能力開放合作的規(guī)劃、政策和措施并推動落實。組織、指導全市企事業(yè)單位與國外組織項目對接和全市引進國外智力成果推廣與示范基地建設工作。按權限承辦科技系統(tǒng)人員的因公出國（境）任務審批工作。
（十）機關黨委辦公室（人事科）。負責機關黨群、機構編制、人事管理、干部培訓和隊伍建設等工作，負責機關離退休干部工作。提出科技人才隊伍建設規(guī)劃和政策建議，承擔相關科技人才計劃實施工作，推動高端科技創(chuàng)新人才隊伍建設。負責院士聯(lián)系服務工作。擬訂市科學普及和科學傳播的規(guī)劃、政策。組織推薦申報省自然科學基金及各科技人才類資金計劃，負責組織實施市級各科技人才類資金計劃。
機關黨委辦公室與人事科合署辦公。